SMA Negeri 2 Setu resmi berdiri pada tahun 2021 sebagai wujud nyata dari komitmen pemerintah dalam meningkatkan akses pendidikan menengah atas di wilayah Kecamatan Setu, Kabupaten Bekasi. Pada masa awal berdirinya, sekolah ini dipimpin oleh Plt. Dr. Halimatus Syakdiyah, seorang pendidik berdedikasi yang juga berperan penting dalam meletakkan pondasi awal penyelenggaraan kegiatan belajar mengajar.

Lokasi pertama SMA Negeri 2 Setu berada di Lubang Buaya, Setu, Bekasi, menggunakan fasilitas sementara sambil menanti pembangunan gedung permanen. Meskipun dengan sarana prasarana yang masih terbatas, semangat para pendidik dan siswa tidak pernah surut dalam menjalankan proses pembelajaran.

Memasuki tahun 2022, sekolah ini resmi pindah ke lokasi baru di Desa Ragemanunggal, Setu, Bekasi. Lokasi baru ini berada di atas lahan yang luas dan hijau, memberikan potensi besar untuk pengembangan sarana pendidikan yang lebih baik dan representatif. Hingga saat ini, pembangunan fasilitas sekolah masih terus berjalan untuk menunjang kualitas pembelajaran yang lebih optimal.

Pada tahun 2023, kepemimpinan SMA Negeri 2 Setu sempat diamanahkan kepada Bapak Agus Suparman, S.Pd., sebelum akhirnya kembali dipimpin oleh Dr. Halimatus Syakdiyah, M.M., M.Pd. sebagai kepala sekolah definitif. Di bawah kepemimpinan beliau, SMA Negeri 2 Setu terus berbenah, tumbuh menjadi sekolah yang tidak hanya mengedepankan prestasi akademik, tetapi juga karakter dan budaya positif di lingkungan sekolah.

Kini, SMA Negeri 2 Setu berdiri sebagai simbol semangat baru pendidikan di wilayah Setu, dengan cita-cita besar membentuk generasi muda yang cerdas, unggul, dan berakhlak mulia.